Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q6DFW0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q6DFW0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q6DFW0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q6DFW0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q6DFW0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Q6DFW0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q6DFW0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q6DFW0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Q6DFW0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q6DFW0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q6DFW0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q6DFW0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q6DFW0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q6DFW0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q6DFW0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q6DFW0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q6DFW0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q6DFW0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q6DFW0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q6DFW0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q6DFW0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Q6DFW0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q6DFW0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q6DFW0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Q6DFW0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q6DFW0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Q6DFW0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q6DFW0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q6DFW0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q6DFW0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Q6DFW0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q6DFW0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q6DFW0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Q6DFW0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Q6DFW0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q6DFW0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q6DFW0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q6DFW0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q6DFW0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q6DFW0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q6DFW0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q6DFW0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q6DFW0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q6DFW0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q6DFW0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q6DFW0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q6DFW0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q6DFW0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q6DFW0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q6DFW0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q6DFW0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q6DFW0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q6DFW0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q6DFW0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q6DFW0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q6DFW0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q6DFW0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q6DFW0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q6DFW0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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