Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Pkp4Q68FH0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Pkp4Q68FH0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkp4Q68FH0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Pkp4Q68FH0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp4Q68FH0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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