Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrp4fQ66X05 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms