Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Top2bQ64511 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Top2bQ64511 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Top2bQ64511 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Top2bQ64511 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Top2bQ64511 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Top2bQ64511 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Top2bQ64511 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Top2bQ64511 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Top2bQ64511 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Top2bQ64511 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Top2bQ64511 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Top2bQ64511 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Top2bQ64511 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Top2bQ64511 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Top2bQ64511 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Top2bQ64511 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Top2bQ64511 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Top2bQ64511 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Top2bQ64511 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Top2bQ64511 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Top2bQ64511 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Top2bQ64511 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Top2bQ64511 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms