Protein–RNA interactions for Protein: Q640L3

Ccpg1, Cell cycle progression protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccpg1Q640L3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccpg1Q640L3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccpg1Q640L3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccpg1Q640L3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccpg1Q640L3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms