Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou4f3Q63955 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou4f3Q63955 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms