Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sp4Q62445 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sp4Q62445 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sp4Q62445 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sp4Q62445 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sp4Q62445 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sp4Q62445 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sp4Q62445 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sp4Q62445 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sp4Q62445 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sp4Q62445 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sp4Q62445 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms