Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TrhQ62361 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TrhQ62361 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TrhQ62361 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TrhQ62361 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TrhQ62361 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrhQ62361 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrhQ62361 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TrhQ62361 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TrhQ62361 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TrhQ62361 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms