Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpcQ62241 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpcQ62241 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms