Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Six2Q62232 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Six2Q62232 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Six2Q62232 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six2Q62232 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six2Q62232 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Six2Q62232 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Six2Q62232 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Six2Q62232 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Six2Q62232 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Six2Q62232 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Six2Q62232 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Six2Q62232 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Six2Q62232 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Six2Q62232 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Six2Q62232 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms