Protein–RNA interactions for Protein: Q62230

Siglec1, Sialoadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siglec1Q62230 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Siglec1Q62230 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Siglec1Q62230 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Siglec1Q62230 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Siglec1Q62230 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms