Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ssr4Q62186 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssr4Q62186 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ssr4Q62186 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssr4Q62186 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssr4Q62186 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms