Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prm3Q62100 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prm3Q62100 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Prm3Q62100 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prm3Q62100 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prm3Q62100 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prm3Q62100 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prm3Q62100 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prm3Q62100 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prm3Q62100 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prm3Q62100 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prm3Q62100 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms