Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PrkciQ62074 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkciQ62074 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkciQ62074 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms