Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phox2aQ62066 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms