Protein–RNA interactions for Protein: Q61967

Zfp90, Zinc finger protein 90, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp90Q61967 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp90Q61967 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp90Q61967 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp90Q61967 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp90Q61967 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp90Q61967 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp90Q61967 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp90Q61967 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp90Q61967 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp90Q61967 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp90Q61967 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp90Q61967 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp90Q61967 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp90Q61967 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp90Q61967 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp90Q61967 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp90Q61967 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp90Q61967 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp90Q61967 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp90Q61967 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp90Q61967 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp90Q61967 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 265.9 ms