Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lama3Q61789 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lama3Q61789 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms