Protein–RNA interactions for Protein: Q61553

Fscn1, Fascin, mousemouse

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn1Q61553 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fscn1Q61553 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fscn1Q61553 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fscn1Q61553 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fscn1Q61553 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fscn1Q61553 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fscn1Q61553 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fscn1Q61553 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fscn1Q61553 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fscn1Q61553 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fscn1Q61553 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fscn1Q61553 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fscn1Q61553 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fscn1Q61553 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fscn1Q61553 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fscn1Q61553 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fscn1Q61553 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fscn1Q61553 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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Fscn1Q61553 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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Fscn1Q61553 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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Fscn1Q61553 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fscn1Q61553 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms