Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecm1Q61508 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecm1Q61508 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms