Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsx2Q61412 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vsx2Q61412 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vsx2Q61412 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vsx2Q61412 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vsx2Q61412 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsx2Q61412 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsx2Q61412 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsx2Q61412 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsx2Q61412 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsx2Q61412 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsx2Q61412 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsx2Q61412 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsx2Q61412 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsx2Q61412 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsx2Q61412 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsx2Q61412 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsx2Q61412 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsx2Q61412 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsx2Q61412 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsx2Q61412 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vsx2Q61412 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vsx2Q61412 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms