Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Foxd1Q61345 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Foxd1Q61345 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Foxd1Q61345 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms