Protein–RNA interactions for Protein: Q61206

Pafah1b2, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b2Q61206 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pafah1b2Q61206 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms