Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsg101Q61187 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms