Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf9Q61179 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Irf9Q61179 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Irf9Q61179 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms