Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc9a1Q61165 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc9a1Q61165 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc9a1Q61165 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms