Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prpf4bQ61136 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf4bQ61136 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf4bQ61136 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms