Protein–RNA interactions for Protein: Q61120

Shc3, SHC-transforming protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc3Q61120 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shc3Q61120 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shc3Q61120 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shc3Q61120 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shc3Q61120 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shc3Q61120 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shc3Q61120 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shc3Q61120 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shc3Q61120 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms