Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ift20Q61025 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ift20Q61025 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ift20Q61025 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms