Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JrkQ60976 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JrkQ60976 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JrkQ60976 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JrkQ60976 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
JrkQ60976 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
JrkQ60976 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
JrkQ60976 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JrkQ60976 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JrkQ60976 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
JrkQ60976 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
JrkQ60976 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms