Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kpna1Q60960 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kpna1Q60960 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms