Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Klf4Q60793 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf4Q60793 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms