Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stxbp3Q60770 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stxbp3Q60770 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stxbp3Q60770 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stxbp3Q60770 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Stxbp3Q60770 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Stxbp3Q60770 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Stxbp3Q60770 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stxbp3Q60770 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stxbp3Q60770 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stxbp3Q60770 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stxbp3Q60770 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stxbp3Q60770 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stxbp3Q60770 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stxbp3Q60770 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms