Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcf4Q60722 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcf4Q60722 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms