Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sik1Q60670 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Sik1Q60670 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sik1Q60670 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sik1Q60670 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms