Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema5bQ60519 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sema5bQ60519 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema5bQ60519 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms