Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4H9

Ncoa4, Nuclear receptor coactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa4Q5U4H9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ncoa4Q5U4H9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ncoa4Q5U4H9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ncoa4Q5U4H9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncoa4Q5U4H9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncoa4Q5U4H9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ncoa4Q5U4H9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ncoa4Q5U4H9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ncoa4Q5U4H9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ncoa4Q5U4H9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ncoa4Q5U4H9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ncoa4Q5U4H9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ncoa4Q5U4H9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncoa4Q5U4H9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncoa4Q5U4H9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncoa4Q5U4H9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Ncoa4Q5U4H9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ncoa4Q5U4H9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ncoa4Q5U4H9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncoa4Q5U4H9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncoa4Q5U4H9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ncoa4Q5U4H9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ncoa4Q5U4H9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Ncoa4Q5U4H9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ncoa4Q5U4H9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ncoa4Q5U4H9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ncoa4Q5U4H9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Ncoa4Q5U4H9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ncoa4Q5U4H9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ncoa4Q5U4H9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms