Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdcp1Q5U462 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdcp1Q5U462 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdcp1Q5U462 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdcp1Q5U462 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdcp1Q5U462 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdcp1Q5U462 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdcp1Q5U462 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdcp1Q5U462 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdcp1Q5U462 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdcp1Q5U462 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdcp1Q5U462 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdcp1Q5U462 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdcp1Q5U462 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdcp1Q5U462 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms