Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r195Q5SVD6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms