Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc42Q5SV66 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc42Q5SV66 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc42Q5SV66 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms