Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctc1Q5SUQ9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctc1Q5SUQ9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctc1Q5SUQ9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms