Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ankrd40Q5SUE8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ankrd40Q5SUE8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms