Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sco1Q5SUC9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sco1Q5SUC9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sco1Q5SUC9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms