Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sft2d1Q5SSN7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sft2d1Q5SSN7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms