Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Utp18Q5SSI6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Utp18Q5SSI6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Utp18Q5SSI6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms