Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQX6

Cyfip2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip2Q5SQX6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyfip2Q5SQX6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cyfip2Q5SQX6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyfip2Q5SQX6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyfip2Q5SQX6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyfip2Q5SQX6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyfip2Q5SQX6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyfip2Q5SQX6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyfip2Q5SQX6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyfip2Q5SQX6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyfip2Q5SQX6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyfip2Q5SQX6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyfip2Q5SQX6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyfip2Q5SQX6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyfip2Q5SQX6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyfip2Q5SQX6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms