Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmprss11eQ5S248 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmprss11eQ5S248 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmprss11eQ5S248 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmprss11eQ5S248 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmprss11eQ5S248 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmprss11eQ5S248 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmprss11eQ5S248 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmprss11eQ5S248 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmprss11eQ5S248 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmprss11eQ5S248 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmprss11eQ5S248 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmprss11eQ5S248 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmprss11eQ5S248 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmprss11eQ5S248 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmprss11eQ5S248 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmprss11eQ5S248 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmprss11eQ5S248 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmprss11eQ5S248 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmprss11eQ5S248 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmprss11eQ5S248 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmprss11eQ5S248 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmprss11eQ5S248 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmprss11eQ5S248 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmprss11eQ5S248 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmprss11eQ5S248 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmprss11eQ5S248 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmprss11eQ5S248 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmprss11eQ5S248 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmprss11eQ5S248 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmprss11eQ5S248 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmprss11eQ5S248 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss11eQ5S248 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms