Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm11487Q5RIS0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm11487Q5RIS0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm11487Q5RIS0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm11487Q5RIS0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm11487Q5RIS0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm11487Q5RIS0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm11487Q5RIS0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm11487Q5RIS0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm11487Q5RIS0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm11487Q5RIS0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm11487Q5RIS0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm11487Q5RIS0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm11487Q5RIS0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm11487Q5RIS0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm11487Q5RIS0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm11487Q5RIS0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm11487Q5RIS0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm11487Q5RIS0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm11487Q5RIS0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm11487Q5RIS0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms