Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms