Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Spata48Q5NC83 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spata48Q5NC83 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Spata48Q5NC83 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spata48Q5NC83 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spata48Q5NC83 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spata48Q5NC83 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spata48Q5NC83 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spata48Q5NC83 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spata48Q5NC83 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spata48Q5NC83 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spata48Q5NC83 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spata48Q5NC83 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spata48Q5NC83 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms