Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC57

Fam183b, Protein FAM183B, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam183bQ5NC57 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam183bQ5NC57 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam183bQ5NC57 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam183bQ5NC57 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms